Ubongo Junior 3D je založené na rovnakom princípe. Rozdiel je v tom, že skladačka je trojrozmerná. Deti od 5 rokov tak skladajú vežu do výšky.
V prvom rade majú deti za úlohu zakryť na karte svetlú plochu hernými dielikmi. Potom sa snaží na už hotovej základni zo svojich zvyšných dielikov postaviť čo najvyššiu vežu . To všetko v časovom limite.
Akonáhle vyprší čas, zmeria si výšku svojich veží pomocou špeciálneho žirafometra a dostane zodpovedajúci počet drahokamov .
Víťazí ten, kto má po 6 kolách najviac drahokamov.
Vybrať si môžu zo 4 stupňov obtiažnosti - hra je tak veľmi variabilná a napínavá.
Druhé vydanie sa od staršej verzie líši iba novým grafickým spracovaním . Komponenty aj princíp hry sú rovnaké.
Hra Ubongo Junior 3D obsahuje: 50 kariet so 100 zadaniami, 32 herných dielikov 3D, 120 drahokamov, žirafometer, presýpacie hodiny, plátené vrecko a pravidlá.